本研究对来自41 988例患者的45 259份肿瘤样本开展了全面的泛癌基因突变频率分析,并将样本划分为三类:TP53高突变组(TP53_top)、TP53伴随突变组(TP53_plus)、非TP53突变组(Non_TP53)。
2026年5月14日,郑州大学董子钢团队在Cell Reports(IF=8.1)在线发表题为TP53-based tripartite classification reveals three distinct mutation patterns across pan-cancer的研究论文。
突变基因的交集分析显示,61种癌症之间存在异质性重叠特征。基于样本量、突变频率及分布模式,本研究鉴定出95个显著突变基因,共包含80 524个特有突变,并将其分为三类:单点突变‑单癌型、单点突变‑多癌型、多点突变‑多癌型。
上述结果明确了精准医学发展的两大策略:单点突变特异性靶向与多点突变广谱适配性靶向。此外,研究在19个调控网络中鉴定出26个突变转录因子(TFs)及476个下游靶点,将其分为TP53独立调控型、TP53多因子协同调控型、非TP53调控型。
同时,绘制了52种癌症中47个突变信号通路网络图谱,揭示了多种表型紊乱特征,以及这些突变基因上下游的潜在治疗靶点。泛癌基因型与表型的整合研究,为研发突变特异性、多变异型、背景依赖型的精准靶向治疗方案提供了理论框架。
癌症仍然是全球主要死因之一,每年有数百万新病例被诊断。传统癌症治疗领域正逐步向个体化靶向治疗转型。值得关注的是,靶向治疗与免疫治疗兼具持久疗效与良好安全性,彰显了精准肿瘤学的应用前景。
靶向治疗时代始于伊马替尼(格列卫)—— 这款酪氨酸激酶抑制剂(TKI)于2001 年获美国食品药品监督管理局(FDA)批准上市。作为选择性BCR‑ABL1 激酶抑制剂,格列卫显著改善了慢性粒细胞白血病(CML)患者的预后,其 10 年总生存率可达83.3%。吉非替尼于2003 年获FDA 批准,用于经铂类、多西他赛治疗失败后的局部晚期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC),后续研究证实其对EGFR突变型肿瘤疗效显著。
此后,可有效作用于EGFR T790M 突变的第三代酪氨酸激酶抑制剂奥希替尼,进一步提升了治疗效果。此外,达拉非尼联合曲美替尼(DT)方案,可使约三分之一携带BRAF V600E/K 突变的不可切除或转移性黑色素瘤患者获得长期生存获益。
尽管精准肿瘤学取得了进展,但靶向治疗仍面临重大挑战。在PIK3CA-突变型乳腺癌,alpelisib实现了11.0个月的中位无进展生存期(PFS)。在IDH1突变型肝内胆管癌(ICC)中,艾伏尼布的中位无进展生存期仅2.7个月。
总体而言,上述药物疗效有限,无进展生存期改善幅度较小。新兴药物,如靶向结直肠癌截短型APC的TASIN‑1、靶向胶质瘤突变型IDH1的SYC‑435,目前仍处于临床前研究阶段。
BRAF突变发生在约66%的黑色素瘤中,在其他癌症中的发生频率较低。尽管BRAF抑制剂疗效显著,但受组织微环境、共突变、旁路信号通路激活等因素影响,肿瘤极易产生耐药性。为此,研究者开发联合用药策略以克服耐药。BRAF/MEK抑制剂联合方案(达拉非尼+曲美替尼,DT)可使BRAFV600E/K驱动的肿瘤患者获得持久获益。
相较于单用DT方案,联合帕博利珠单抗可进一步延长BRAFV600E突变型间变性甲状腺癌患者的生存期与无进展生存期。对于奥希替尼或铂类化疗耐药、携带EGFR19外显子缺失或EGFRL858R突变的非小细胞肺癌,阿米万他单抗联合拉泽替尼方案的中位无进展生存期为4.5个月。
即便联合治疗方案,也受限于生物学层面的制约:亚克隆突变或共存驱动基因会降低药物跨癌种疗效。这提示,需系统解析并重新定义泛癌突变图谱,以完善单驱动基因肿瘤及复杂基因组背景下的精准医学方案。
图形摘要(图源自Cell Reports)
针对这一问题,本研究分析了61种癌症、超45000份肿瘤样本的突变图谱,筛选出95个显著突变基因。尽管精准肿瘤学已有突破,本研究结果仍表明,针对异质性突变及现有“不可成药”突变,创新治疗策略的研发需求仍未被满足。
研究绘制了这95个基因的突变景观热图,发现其突变兼具热点聚集与散在分布特征,并汇总了目前FDA获批或处于临床研究阶段的靶向药物,同时分析其癌种特异性与广谱适用性。
本研究提出基于TP53的系统性泛癌三分类分型体系,阐释了突变转录因子(TFs)介导的调控网络紊乱,以及显著突变癌基因影响的信号通路网络。综上,本研究构建了泛癌背景下优化突变指导型治疗策略的理论框架。
参考消息:10.1016/j.celrep.2026.117337