CRISPR-Cas系统是细菌对抗病毒(噬菌体)的免疫利器,它像一把分子剪刀,能够识别并切割入侵病毒的DNA。正因如此,CRISPR已经成为基因编辑领域不可或缺的工具。然而,病毒并非坐以待毙。它们编码一类叫作“抗CRISPR”(Acr)的蛋白质,能够抑制CRISPR-Cas系统的活性,通常的方式是直接阻断剪刀与DNA的结合或者阻止其切割。但最新研究发现了一种颠覆性的全新机制:一种病毒蛋白干脆不让细菌把剪刀造出来。
这篇发表在国际杂志Nature上题为“Translation-dependent degradation of cas12 mRNA triggered by an anti-CRISPR”的研究报告中,来自加州大学旧金山分校等机构的研究人员发现,一种名为AcrVA2的抗CRISPR蛋白并不攻击已经组装完成的Cas12(Cas12是CRISPR系统中的一种效应蛋白),而是瞄准了细菌内部的“蛋白质生产线”——核糖体。当核糖体刚刚开始根据cas12基因的mRNA蓝图合成Cas12蛋白时,AcrVA2就出手了。它会结合到正在生长的Cas12蛋白的N端附近,触发核糖体的质量控制机制,导致正在诞生的Cas12蛋白以及其对应的mRNA模板一同被降解。
这个机制的精妙之处在于它的选择性。研究人员逐一排查了从DNA到mRNA再到蛋白质的每一个环节。AcrVA2既不会阻止cas12基因的转录(那样会直接阻断mRNA的产生),也无法在试管中直接降解mRNA。于是他们将目光投向了核糖体。结果发现,AcrVA2有两个关键结构域:其一端的结构域能够稳定结合在核糖体上,仿佛一只手搭在生产线上;另一端的结构域则像一个精准的识别探头,只有当核糖体翻译出Cas12蛋白最开头那几个特征性的氨基酸残基时,AcrVA2才会紧紧抓住这个新生蛋白。一旦抓住,它就强行让核糖体“卡壳”,并诱导细菌自身的质量控制系统将这条生产线彻底报废—新生蛋白被降解,mRNA蓝图也被一并销毁。
此前已知的抗CRISPR蛋白大多通过结合成熟的Cas蛋白来抑制其功能,而AcrVA2是迄今为止发现的唯一一个在蛋白质翻译过程中就进行干预的案例。更值得注意的是,AcrVA2的C端结构域保守性很强,广泛存在于多种移动遗传元件编码的同源蛋白中,而这些元件的宿主细菌很多本身并不携带cas12基因。这暗示,这类蛋白可能还识别并下调其他未知的底物,在更广泛的细菌基因调控中发挥作用。
这项研究不仅揭示了一种前所未有的分子冲突机制—一个蛋白质通过干扰另一个蛋白质在核糖体上的合成来达成目的,也为我们理解细菌与病毒之间数亿年的进化军备竞赛增添了新的篇章。从应用角度看,理解病毒的“反制”策略有助于科学家优化CRISPR基因编辑工具,或者在将来设计出能够抵抗这类抗CRISPR蛋白干扰的工程化Cas系统。当然,目前的研究仍集中在分子机制层面,距离临床转化还有很长的路要走。但无论如何,这个故事再次证明了:在微观世界的生存博弈中,攻防双方的智慧远超人类的想象。(生物谷Bioon.com)
参考文献:
Marino, N.D., Talaie, A., Gerovac, M. et al. Translation-dependent degradation of cas12 mRNA triggered by an anti-CRISPR. Nature (2026). doi:10.1038/s41586-026-10440-8.